Нативні фітонциди грають важливу роль в імунітеті рослин і у взаєминах організмів в біогеоценозах. Виділення ряду фітонцидів посилюється при пошкодженні рослин. Летючі фітонциди (ЛАВ) здатні надавати свою дію на відстані, наприклад фітонциди листя дуба, евкаліпта, сосни і багатьох ін.